南京医科大学保卫处(部)是承担学校安全管理、维护学校稳定秩序的职能部门。保卫处(部)以“服务师生需求、构建平安校园、保障一流建设”为工作目标,秉持“以人为本、预防为主、规范管理、系统治理”的基本原则,面向南京医科大学全体师生,开展安全管理、安全教育和安全服务。保卫处(部)具体负责治安、交通、消防、校园秩序、集体户口、安全宣传教育、信息调研等日常管理工作,建设维护安全技术防范系统,履行对校内单位安全管理工作的指导、检查、协调、服务职能,落实安全管理法规,完善校内安全管理制度,协助、配合政府有关部门开展工作,为营建平安和谐的校园育人氛围、促进学校事业发展保驾护航。

   保卫处(部)下设治安科、消防科、技防科、户籍科四个科室,现有工作人员18人,校卫队员67人。